農藥殘留檢測儀采用酶抑制原理檢測農藥殘留是否超標，在檢測過程中，酶抑制法主要針對的是有機磷農藥，因此農藥殘留檢測儀檢測的重點是有機磷農藥。有機磷農藥是指用于防治植物病蟲草害的含有磷元素的有機化合物農藥，這類農藥品種繁多，用途廣泛。在農藥中是極為重要的一類有機化合物。

有一部分品種對人畜的毒性較強，但有不少品種對人、畜的急性毒性很強，長期或者大劑量接觸后容易引起一些神經中毒的癥狀，所以在使用時一定要特別注意。而且有機磷農藥的揮發性較弱，在噴灑過程中容易導致農藥殘留的產生。

長時間食用有機磷農藥超標的農產品會危害人體健康。所以利用農藥殘留檢測儀進行檢測是必備環節，最大限度的減少人們對有機磷農藥殘留的攝入。農業生產過程中，使用農藥殘留檢測儀檢測作物中的有機磷農藥殘留量，對維持作物高產，增加農戶收入，保證消費者健康有著重要的意義。

農藥殘留檢測儀其工作原理可簡單理解為：將果蔬有效部分提取到液體，利用膽堿酯酶的催化反應，并將其分解物轉變為顏色，設定一組不含農藥的標準液，正常情況下其顏色會比較深，將其作為參照，如果被測樣品含有農藥，其反應就會被抑制，導致顏色很淺，通過抑制率的計算即可判定陰陽性結果。

蔥、蒜、蘿卜、韭菜、芹菜、香菜、茭白、蘑菇及番茄汁液中含有對酶有影響的植物次生物質，容易產生假陽性，處理這類樣品時，可采用整株蔬菜浸提，對一些含葉綠素較高的蔬菜，也可采用整株蔬菜浸提的方法，減少色素的干擾。各廠家操作儀器操作方法不一，具體看各出場說明書。